2013年7月，習近平總書記視察中國科學院，明確提出要“率先建成國家高水平科技智庫”。2015年5月，中國科學院組建非法人實體中國科學院科技戰略咨詢研究院，掛靠中國科學院科技政策與管理科學研究所，統籌協調中科院科研院所、學部、教育機構相關研究資源、隊伍和平臺，探索建立持續開展戰略研究的機制。2015年11月，中國科學院被確定為黨中央、國務院、中央軍委直屬的首批10家第一類高端智庫建設試點單位之一，并明確試點的重點任務是建設戰略咨詢院。2015年12月，中國科學院黨組決定，以中國科學院科技政策與管理科學研究所更名的方式組建事業法人機構戰略咨詢院。2016年1月，戰略咨詢院正式組建，通過整合中科院文獻情報中心、地理科學與資源研究所等單位的相關研究力量，推進深化改革工作。2016年10月，中央編辦批準中國科學院科技政策與管理科學研究所正式更名為中國科學院科技戰略咨詢研究院。

　　中國科學院科技政策與管理科學研究所于1985年在中國科學院政策研究室、管理科學組、《自然辯證法通訊》雜志社合并基礎上組建。1987年，中國科學院應用數學研究所優選法與管理科學研究室整建制劃入，是兼具學術研究和政策咨詢功能的智庫型研究所。30多年來，研究所政策科學、公共管理、管理科學與工程、技術經濟及管理等四大學科建設成效顯著，在科技發展、創新發展、可持續發展等領域形成了戰略、政策和管理三個層次協調發展的學科布局，涌現出一批在國內外有影響力的研究團隊，先后獲得國家科技進步獎6項、省部級科技獎勵30余項，為國家科技體制改革、高技術產業園區發展、自主創新能力建設、戰略性新興產業發展、激勵企業創新政策等宏觀管理決策提供了重要研究咨詢支撐，建立了全球化、高層次的學術交流與合作網絡。

　　戰略咨詢院設有聯合辦公室、科技管理處、財務資產處、人事教育處、對外合作交流處、重大任務管理集成部、信息網絡與傳播中心等7個管理部門。設有科技發展戰略研究所、創新發展政策研究所、可持續發展戰略研究所、系統分析與管理研究所、科技戰略情報研究所等5個研究所。設有學部咨詢研究支撐中心、學部學科研究支撐中心、學部科學規范與倫理研究支撐中心、學部科普與教育研究支撐中心、第三方評估研究支撐中心等5個學部研究支撐中心。設有中國科學院中國創新戰略和政策研究中心、中國科學院創新發展研究中心、中國科學院管理創新與評估研究中心等3個中科院院級研究中心。設有政策模擬研究中心、國際問題研究中心、統籌與安全管理研究中心、中國高新區研究中心、環境政策研究中心、社會治理與風險研究中心、大數據戰略研究中心、產業科技創新研究中心等8個戰略咨詢院交叉研究單元。掛靠管理中國科學學與科技政策研究會、中國優選法統籌法與經濟數學研究會、中國發展戰略學研究會等3個全國一級學會，以及中國高技術產業發展促進會等。主辦國家自然科學基金委“中國管理科學A級重要期刊”《中國管理科學》《科研管理》《科學學研究》，主辦Innovation and Development Policy英文期刊，與學部共同主辦《科學與社會》學術期刊?！吨袊茖W院院刊》是中科院主辦的綜合科技類刊物，是國家科學思想庫的核心媒體，該刊編輯部掛靠戰略咨詢院。

　　戰略咨詢院是中國科學院大學公共政策與管理學院的主承辦單位。設有“管理科學與工程”“公共管理”一級學科碩士和博士學位培養點，“情報學”二級學科碩士培養點?！肮芾砜茖W與工程”學科曾獲北京市重點學科資助，并設有博士后科研流動站。  

　　戰略咨詢院已與國際上近30個著名的科研機構、大學形成戰略合作伙伴關系，并創建了中俄科技與創新合作研究中心、中德聯合創新研究中心、中芬科技與創新合作中心三個機制化合作研究機構，發起成立了近40家重要研究機構和著名大學參加的中英創新戰略和政策研究網絡。依托“一帶一路”國際科學組織聯盟（ANSO），組建專題聯盟“ANSO創新與可持續政策聯盟”。　　 

　　面向未來，戰略咨詢院將發揮中國科學院集科研院所、學部、教育機構為一體的優勢，從科技規律出發研判科技發展趨勢和突破方向，從科技影響的角度研究經濟社會發展和國家安全重大問題，聚焦科技發展戰略、科技和創新發展政策、生態文明與可持續發展戰略、預測預見分析、戰略情報等領域，匯聚國內外優秀人才，建設開放合作的戰略與政策國際研究網絡，為國家宏觀決策提供科學依據和政策依據，努力成為全球科學技術和創新發展政策思想引領者。

　?。?021年12月更新）